Ευάγγελος Κωλέττας

Εργαστήριο Μοριακής Κυτταρικής Βιολογίας του Καρκίνου και της Γήρανσης

Το εργαστήριό έχει δύο ερευνητικές κατευθύνσεις: (α) Κυτταρική σηματοδότηση και ρυθμιστικά δίκτυα σε βλάβες του DNA και στη φλεγμονή που εμπλέκονται στην κυτταρική γήρανση και τον καρκίνο, με έμφαση στις πορείες σηματοδότησης του μεταγραφικού παράγοντα NF-κB, και (β) Ταυτοποίηση νέων πρωτεϊνών ρύθμισης των αποκρίσεων σε βλάβες του DNA και της φλεγμονής που εμπλέκονται στην κυτταρική γήρανση και στον καρκίνο, μέσω σάρωσης μεγάλης κλίμακας με την τεχνολογία CRISPR/Cas9.

(α) Κυτταρική σηματοδότηση και ρυθμιστικά δίκτυα σε βλάβες του DNA και στη φλεγμονή που εμπλέκονται στην κυτταρική γήρανση και τον καρκίνο, με έμφαση στις πορείες σηματοδότησης του μεταγραφικού παράγοντα NF-κB.

Οι μεταγραφικοί παράγοντες μεταγραφής (TFs) NF-κB είναι σημαντικοί ρυθμιστές των προ-φλεγμονωδών και στρεσογόνων αποκρίσεων, και τα σηματοδοτικά μόρια τους υπερεκφράζονται ή ενεργοποιούνται σε παθήσεις του πνεύμονα, καθώς επίσης και στο μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (non-small cell lung cancer; NSCLC), με δυσμενή πρόγνωση για την επιβίωση των ασθενών. Η ενεργοποίηση των μεταγραφικών παραγόντων NF-κB επιτυγχάνεται με δύο κύριες πορείες σηματοδότησης: Μία κανονική σηματοδοτική πορεία ενεργοποίησης του NF-κB διαμεσολαβούμενη από την κινάση σερίνης/θρεονίνης (Ser/Thr) ΙΚΚβ με την οποία τα ετεροδιμερή των υπομονάδων c-Rel-p50 ή RelA/p65-p50 μετατοπίζονται στον πυρήνα και ρυθμίζουν την έκφραση γονιδίων-στόχων τους (ΙΚΚβ-RelA/p50), και μια μη-κανονική ή εναλλακτική σηματοδοτική πορεία ενεργοποίησης του NF-κB διαμεσολαβούμενη από την κινάση Ser/Thr ΙΚΚα με την οποία τα ετεροδιμερή των υπομονάδων ρ52/RelB μετατοπίζονται στον πυρήνα και ρυθμίζουν την έκφραση ενός διαφορετικού υποσυνόλου γονιδίων-στόχων τους (ΙΚΚα-RelB/p52).

Χρησιμοποιώντας κυτταρικά συστήματα in vitro και νέα διαγονιδιακά μοντέλα καρκίνου του πνεύμονα ποντικού in vivo, μελετάμε τα ακόλουθα:

1. Ρόλος των ΙΚΚ/NF-κΒ στον κυτταρικό και μεταβολικό επαναπρογραμματισμό που προκαλείται από ογκογονίδια και επηρεάζει την αναδιαμόρφωση της χρωματίνης στο NSCLC
2. Εμπλοκή του ρυθμιστικού δικτύου NF-κB-miRNA στο NSCLC
3. Αλληλεπίδραση μεταξύ των πορειών βλαβών στο DNA και του σημείου ελέγχου της συναρμολόγησης της μιτωτικής ατράκτου: Ρόλος των ΙΚΚ/NF-κΒ
4. Αλλαγές που προκαλούνται από στρεσογόνους παράγοντες στο μάτισμα και στη μετάφραση κατά την ανοσία και τον καρκίνο του πνεύμονα
5. Ρόλος και μηχανισμοί δράσης της IKKα στην κυτταρική γήρανση

(β) Ταυτοποίηση νέων πρωτεϊνών ρύθμισης των αποκρίσεων σε βλάβες του DNA και της φλεγμονής που εμπλέκονται στην κυτταρική γήρανση και στον καρκίνο, μέσω σάρωσης μεγάλης κλίμακας με την τεχνολογία CRISPR/Cas9.

Θα χρησιμοποιήσουμε λεντιϊκές βιβλιοθήκες CRISPR/Cas9 για την απενεργοποίηση πρωτεϊνικών κινασών, μεταγραφικών παραγόντων ή επιγενετικών ρυθμιστών για να ταυτοποιηθούν νέοι ρυθμιστές των αποκρίσεων σε βλάβες του DNA και στη φλεγμονή διαδικασίες που εμπλέκονται στην κυτταρική γήρανση και στον καρκίνο, συμπεριλαμβανομένης της ανθεκτικότητας σε χημικοθεραπευτικούς παράγοντες, μέσω σάρωσης μεγάλης κλίμακας με την τεχνολογία CRISPR/Cas9.